Cellular Senescence RT reaction & qPCR 레포트

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목차

Cellular Senescence RT reaction & qPCR
Ⅰ. 서론
Ⅱ.재료 및 방법
Ⅲ.결과
Ⅳ. 논의
Ⅴ.참고 문헌

본문내용

로 안정적으로 발현되어야 한다. β-actin은 세포골격의 주요 구성 요소이며 증식, 접착, 운동성, 성장 및 사이토카인시스와 같은 다양한 세포 기능에 관여한다 (Sobierajska et al, 2014). β-actin은 모든 조직에서 안정적으로 발현되는 유전자이며 세포의 기본적인 생존에 필요한 기능을 수행하고 있다. 이러한 특성은 β-actin이 본 실험에서 House keeping gene으로 사용되기에 적합하다고 볼 수 있다. 다음으로 House keeping gene으로 사용되기 위해서 쉽게 측정 가능해야 한다. 선행된 연구 “Optimization of annealing temperature to reduce bias caused by a primer mismatch in DNA amplification” (Zeng et al, 2003)에서 PCR 증폭의 효율을 높이기 위한 여러 가지 방법 중 하나로, 적절한 길이와 GC 함량을 가진 DNA 조각을 사용하는 것을 언급하고 있으며, 길이와 GC 함량이 PCR 증폭 효율에 영향을 미치고 있다고 소개하고 있다. 또 다른 연구 “Validation of Zebrafish (Danio rerio) Reference Genes for Quantitative Real-time RT-PCR Normalization” (Tang et al, 2007)에서는 β-actin은 PCR 증폭에 용이한 길이와 GC 함량을 가진 유전자로 소개하고 있다. 이를 통해 β-actin은 쉽게 측정 가능하며 House keeping gene으로서 적합하다고 생각할 수 있다.
Ⅴ.참고 문헌
·Kong et al, 2014, Identification of Suitable Reference Genes for Gene Expression Normalization in qRT-PCR Analysis in Watermelon, PLOS　ONE, pp 90612
·Stephanie et al, 2009, Normalization of qRT-PCR data: the necessity of adopting a systematic, experimental conditions-specific, validation of references, Journal of Experimental Botany, pp. 487493
·Steven et al, 2003, Demonstration of preferential binding of SYBR Green I to specific DNA fragments in realtime multiplex PCR, Nucleic Acids Research, p.136
·Titli et al, 2018, Significance of circulatory DPP4 activity in metabolic diseases, IUBMB life, pp.112-119
·Sobierajska et al, 2014, Protein disulfide isomerase directly interacts with β-actin Cys374 and regulates cytoskeleton reorganization., Journal of Biological Chemistry pp.5758-5773.
·TAYLOR et al, 2021, Campbell Biology, 라이프사이언스, p.234
·Kim et al, 2019, Senotherapeutics: emerging strategy for healthy aging and age-related disease, BMB Rep, pp 47-55
·Solerte et al, 2020, Dipeptidyl peptidase-4 (DPP4) inhibition in COVID-19, Acta diabetologica, pp.779-783
·Zeng et al, 2003, Optimization of annealing temperature to reduce bias caused by a primer mismatch in DNA amplification, BioTechniques, pp 692-698
·Tang et al, 2007, Validation of Zebrafish (Danio rerio) Reference Genes for Quantitative Real-time RT-PCR Normalization, Acta Biochimica et Biophysica Sinica, pp 384-390

키워드

RT reaction,   qPCR,   qRT–PCR,   DNA,   RNA,   알티피씨알,   피씨알,   Proliferating cell,   Senescent cell