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만배 (2ⁿ배 : n=cycle수)로 증폭하여 검출하는 방법으로, 이 방법을 이용했을 때 결핵 및 비결핵성항산균 감염증을 신속하면서도 고감도로 찾아낼 수 있다. 많은 보고에서 결핵균 DNA검출을 위한 PCR 감도는 배양균을 사용했을 경우에 5균체이하로 매우 민감한 검사법이다. 그러나 주의할 점은 위음성문제와 오염에 의한 위양성문제를 방지하는 것이다.
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